Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

DCLRE1A (DNA cross-link repair 1A)

Identity

Alias (NCBI)PSO2
SNM1
SNM1A
HGNC (Hugo) DCLRE1A
HGNC Alias symbSNM1
PSO2
KIAA0086
hSNM1
HGNC Alias namePSO2 homolog (S. cerevisiae)
HGNC Previous nameDNA cross-link repair 1A (PSO2 homolog, S. cerevisiae)
LocusID (NCBI) 9937
Atlas_Id 40271
Location 10q25.3  [Link to chromosome band 10q25]
Location_base_pair Starts at 113834725 and ends at 113854082 bp from pter ( according to hg38-Dec_2013)
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)
SLC1A3 (5p13.2) / DCLRE1A (10q25.3)

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 



External links

 

Nomenclature
HGNC (Hugo)DCLRE1A   17660
Cards
Entrez_Gene (NCBI)DCLRE1A    DNA cross-link repair 1A
AliasesPSO2; SNM1; SNM1A
GeneCards (Weizmann)DCLRE1A
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000198924 [Gene_View]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000198924 [Gene_View]  ENSG00000198924 [Sequence]  chr10:113834725-113854082 [Contig_View]  DCLRE1A [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000198924
TCGA cBioPortalDCLRE1A
AceView (NCBI)DCLRE1A
Genatlas (Paris)DCLRE1A
SOURCE (Princeton)DCLRE1A
Genetics Home Reference (NIH)DCLRE1A
Genomic and cartography
GoldenPath hg38 (UCSC)DCLRE1A  -     chr10:113834725-113854082 -  10q25.3   [Description]    (hg38-Dec_2013)
GoldenPath hg19 (UCSC)DCLRE1A  -     10q25.3   [Description]    (hg19-Feb_2009)
GoldenPathDCLRE1A - 10q25.3 [CytoView hg19]  DCLRE1A - 10q25.3 [CytoView hg38]
ImmunoBaseENSG00000198924
Genome Data Viewer NCBIDCLRE1A [Mapview hg19]  
OMIM609682   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AK307187 BC013124 BC062582 D42045 DA456679
RefSeq transcript (Entrez)NM_001271816 NM_014881
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)DCLRE1A
Gene ExpressionDCLRE1A [ NCBI-GEO ]   DCLRE1A [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   DCLRE1A [ SEEK ]   DCLRE1A [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)DCLRE1A [ Firebrowse - Broad ]
GenevisibleExpression of DCLRE1A in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)9937
GTEX Portal (Tissue expression)DCLRE1A
Human Protein AtlasENSG00000198924-DCLRE1A [pathology]   [cell]   [tissue]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtQ6PJP8   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtQ6PJP8  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProQ6PJP8
PhosPhoSitePlusQ6PJP8
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)ZF_UBZ4 (PS51908)   
Domains : Interpro (EBI)DRMBL    Rad18_UBZ4    RibonucZ/Hydroxyglut_hydro   
Domain families : Pfam (Sanger)DRMBL (PF07522)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam07522   
Conserved Domain (NCBI)DCLRE1A
PDB (RSDB)4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
PDB Europe4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
PDB (PDBSum)4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
PDB (IMB)4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
Structural Biology KnowledgeBase4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
SCOP (Structural Classification of Proteins)4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
CATH (Classification of proteins structures)4B87    5AHR    5NZW    5NZX    5NZY    5Q1J    5Q1K    5Q1L    5Q1M    5Q1N    5Q1O    5Q1P    5Q1Q    5Q1R    5Q1S    5Q1T    5Q1U    5Q1V    5Q1W    5Q1X    5Q1Y    5Q1Z    5Q20    5Q22    5Q23    5Q24    5Q25    5Q26    5Q27    5Q28    5Q29    5Q2A    5Q2B    5Q2C    5Q2D    5Q2E    5Q2F    5Q2G    5Q2H    5Q2I    5Q2J    5Q2K    5Q2L    5Q2M    5Q2N    5Q2O    5Q2P    5Q2Q    5Q2R    5Q2S    5Q2T    5Q2U    5Q2V    5Q2W    5Q2X    5Q2Y    5Q2Z    5Q30    5Q31    5Q32    5Q33    5Q34    5Q35    5Q36    5Q37    5Q38    5Q39    5Q3A    5Q3B    5Q3C    5Q3D    5Q3E    5Q3F    5Q3G    5Q3H    5Q3I    5Q3J    5Q3K    5Q3L    5Q3M    5Q3N    5Q3O    5Q3P    5Q3Q    5Q3R    5Q3S    5Q3T    5Q3U    5Q3V    5Q3W    5Q3X    5Q3Y    5Q3Z    5Q40    5Q41    5Q42    5Q43    5Q44    5Q45    5Q46    5Q47    5Q48    5Q49    5Q4A    5Q4B    5Q4C    5Q4D    5Q4E    5Q4F    5Q4G    5Q4H    5Q4I    5Q4J    5Q4K    5Q4L    5Q4M    5Q4N    5Q4O    5Q4P    5Q4Q    5Q4R    5Q4S    5Q4T    5Q4U    5Q4V    5Q4W    5Q4X    5Q4Y    5Q4Z    5Q50    5Q51    5Q52    5Q53    5Q54    5Q55    5Q56    5Q57    5Q58    5Q59    5Q5A    5Q5B    5Q5C    5Q5D    5Q5E    5Q5F    5Q5G    5Q5H    5Q5I    5Q5J    5Q5K    5Q5L    5Q5M    5Q5N    5Q5O    5Q5P    5Q5Q    5Q5R    5Q5S    5Q5T    5Q5U    5Q5V    5Q5W    5Q5X    5Q5Y    5Q5Z    5Q60    5Q61    5Q62    5Q63    5Q64    5Q65    5Q66    5Q67    5Q68    5Q69    5Q6A    5Q6B    5Q6C    5Q6D    5Q6E    5Q6F    5Q6G    5Q6H    5Q6I    5Q6J    5Q6K    5Q6L    5Q6M    5Q6N    5Q6O    5Q6P    5Q6Q    5Q6R    5Q6S    5Q6T    5Q6U    5Q6V    5Q6W    5Q6X    5Q6Y    5Q6Z    5Q70    5Q71    5Q72    5Q73    5Q74    5Q75    5Q76    5Q77    5Q78    5Q79    5Q7A    5Q7B    5Q7C    5Q7D    5Q7E    5Q7F    5Q7G    5Q7H    5Q7I    5Q7J    5Q7K    5Q7L    5Q7M    5Q7N    5Q7O    5Q7P    5Q7Q    5Q7R    5Q7S    5Q7T    5Q7U    5Q7V    5Q7W    5Q7X    5Q7Y    5Q7Z    5Q80    5Q81    5Q82    5Q83    5Q84    5Q85    5Q86    5Q87    5Q88    5Q89    5Q8A    5Q8B    5Q8C    5Q8D    5Q8E    5Q8F    5Q8G    5Q8H    5Q8I    5Q8J    5Q8K    5Q8L    5Q8M    5Q8N    5Q8O    5Q8P    5Q8Q    5Q8R    5Q8S    5Q8T    5Q8U    5Q8V    5Q8W    5Q8X    5Q8Y    5Q8Z    5Q90    5Q91    5Q92    5Q93    5Q94    5Q95    5Q96    5Q97    5Q98    5Q99    5Q9A    5Q9B    5Q9C    5Q9D    5Q9E    5Q9F    5Q9G    5Q9H    5Q9I    5Q9J    5Q9K    5Q9L    5Q9M    5Q9N    5Q9O    5Q9P    5Q9Q    5Q9R    5Q9S    5Q9T    5Q9U    5Q9V    5Q9W    5Q9X    5Q9Y    5Q9Z    5QA0    5QA1    5QA2   
SuperfamilyQ6PJP8
AlphaFold pdb e-kbQ6PJP8   
Human Protein Atlas [tissue]ENSG00000198924-DCLRE1A [tissue]
HPRD08519
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)Q6PJP8
IntAct (EBI)Q6PJP8
BioGRIDDCLRE1A
STRING (EMBL)DCLRE1A
ZODIACDCLRE1A
Ontologies - Pathways
QuickGOQ6PJP8
Ontology : AmiGOfibrillar center  damaged DNA binding  nucleoplasm  nucleoplasm  double-strand break repair via nonhomologous end joining  cell cycle  protection from non-homologous end joining at telomere  5'-3' exodeoxyribonuclease activity  5'-3' exodeoxyribonuclease activity  interstrand cross-link repair  interstrand cross-link repair  metal ion binding  cell division  nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis  
Ontology : EGO-EBIfibrillar center  damaged DNA binding  nucleoplasm  nucleoplasm  double-strand break repair via nonhomologous end joining  cell cycle  protection from non-homologous end joining at telomere  5'-3' exodeoxyribonuclease activity  5'-3' exodeoxyribonuclease activity  interstrand cross-link repair  interstrand cross-link repair  metal ion binding  cell division  nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis  
NDEx NetworkDCLRE1A
Atlas of Cancer Signalling NetworkDCLRE1A
Wikipedia pathwaysDCLRE1A
Orthology - Evolution
OrthoDB9937
GeneTree (enSembl)ENSG00000198924
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamDCLRE1A
Homologs : HomoloGeneDCLRE1A
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)DCLRE1A
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : QuiverDCLRE1A
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerDCLRE1A [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)DCLRE1A
dbVarDCLRE1A
ClinVarDCLRE1A
MonarchDCLRE1A
1000_GenomesDCLRE1A 
Exome Variant ServerDCLRE1A
GNOMAD BrowserENSG00000198924
Varsome BrowserDCLRE1A
ACMGDCLRE1A variants
VarityQ6PJP8
Genomic Variants (DGV)DCLRE1A [DGVbeta]
DECIPHERDCLRE1A [patients]   [syndromes]   [variants]   [genes]  
CONAN: Copy Number AnalysisDCLRE1A 
Mutations
ICGC Data PortalDCLRE1A 
TCGA Data PortalDCLRE1A 
Broad Tumor PortalDCLRE1A
OASIS PortalDCLRE1A [ Somatic mutations - Copy number]
Somatic Mutations in Cancer : COSMICDCLRE1A  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Somatic Mutations in Cancer : COSMIC3DDCLRE1A
Mutations and Diseases : HGMDDCLRE1A
LOVD (Leiden Open Variation Database)[gene] [transcripts] [variants]
BioMutaDCLRE1A
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)DCLRE1A
DoCM (Curated mutations)DCLRE1A
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)DCLRE1A
Cancer3DDCLRE1A
Impact of mutations[PolyPhen2] [Provean] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM609682   
Orphanet
DisGeNETDCLRE1A
MedgenDCLRE1A
Genetic Testing Registry DCLRE1A
NextProtQ6PJP8 [Medical]
GENETestsDCLRE1A
Target ValidationDCLRE1A
Huge Navigator DCLRE1A [HugePedia]
ClinGenDCLRE1A
Clinical trials, drugs, therapy
MyCancerGenomeDCLRE1A
Protein Interactions : CTDDCLRE1A
Pharm GKB GenePA27174
PharosQ6PJP8
Clinical trialDCLRE1A
Miscellaneous
canSAR (ICR)DCLRE1A
HarmonizomeDCLRE1A
DataMed IndexDCLRE1A
Probes
Litterature
PubMed32 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
EVEXDCLRE1A
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Mon Oct 4 15:06:14 CEST 2021

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.