Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology


Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

X Y 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 NA

KDM4D (lysine demethylase 4D)

Identity

Alias_namesJMJD2D
jumonji domain containing 2D
lysine (K)-specific demethylase 4D
Alias_symbol (synonym)FLJ10251
Other alias
HGNC (Hugo) KDM4D
LocusID (NCBI) 55693
Atlas_Id 47034
Location 11q21  [Link to chromosome band 11q21]
Location_base_pair Starts at 94973681 and ends at 94999512 bp from pter ( according to hg38-Dec_2013)
Fusion genes
(updated 2017)
Data from Atlas, Mitelman, Cosmic Fusion, Fusion Cancer, TCGA fusion databases with official HUGO symbols (see references in chromosomal bands)

Note

Non-annotated gene. Preliminary data : if you are an author
who wish to write a full paper/card on this gene, go to  How to contribute

DNA/RNA

 


External links

Nomenclature
HGNC (Hugo)KDM4D   25498
Cards
Entrez_Gene (NCBI)KDM4D  55693  lysine demethylase 4D
AliasesJMJD2D
GeneCards (Weizmann)KDM4D
Ensembl hg19 (Hinxton)ENSG00000186280 [Gene_View]
Ensembl hg38 (Hinxton)ENSG00000186280 [Gene_View]  ENSG00000186280 [Sequence]  chr11:94973681-94999512 [Contig_View]  KDM4D [Vega]
ICGC DataPortalENSG00000186280
TCGA cBioPortalKDM4D
AceView (NCBI)KDM4D
Genatlas (Paris)KDM4D
WikiGenes55693
SOURCE (Princeton)KDM4D
Genetics Home Reference (NIH)KDM4D
Genomic and cartography
GoldenPath hg38 (UCSC)KDM4D  -     chr11:94973681-94999512 +  11q21   [Description]    (hg38-Dec_2013)
GoldenPath hg19 (UCSC)KDM4D  -     11q21   [Description]    (hg19-Feb_2009)
EnsemblKDM4D - 11q21 [CytoView hg19]  KDM4D - 11q21 [CytoView hg38]
Mapping of homologs : NCBIKDM4D [Mapview hg19]  KDM4D [Mapview hg38]
OMIM609766   
Gene and transcription
Genbank (Entrez)AK001113 AK056162 AL137545 AW593120 BC031862
RefSeq transcript (Entrez)NM_018039
RefSeq genomic (Entrez)
Consensus coding sequences : CCDS (NCBI)KDM4D
Cluster EST : UnigeneHs.503598 [ NCBI ]
CGAP (NCI)Hs.503598
Alternative Splicing GalleryENSG00000186280
Gene ExpressionKDM4D [ NCBI-GEO ]   KDM4D [ EBI - ARRAY_EXPRESS ]   KDM4D [ SEEK ]   KDM4D [ MEM ]
Gene Expression Viewer (FireBrowse)KDM4D [ Firebrowse - Broad ]
SOURCE (Princeton)Expression in : [Datasets]   [Normal Tissue Atlas]  [carcinoma Classsification]  [NCI60]
GenevestigatorExpression in : [tissues]  [cell-lines]  [cancer]  [perturbations]  
BioGPS (Tissue expression)55693
GTEX Portal (Tissue expression)KDM4D
Human Protein AtlasENSG00000186280-KDM4D [pathology]   [cell]   [tissue]
Protein : pattern, domain, 3D structure
UniProt/SwissProtQ6B0I6   [function]  [subcellular_location]  [family_and_domains]  [pathology_and_biotech]  [ptm_processing]  [expression]  [interaction]
NextProtQ6B0I6  [Sequence]  [Exons]  [Medical]  [Publications]
With graphics : InterProQ6B0I6
Splice isoforms : SwissVarQ6B0I6
Catalytic activity : Enzyme1.14.11.- [ Enzyme-Expasy ]   1.14.11.-1.14.11.- [ IntEnz-EBI ]   1.14.11.- [ BRENDA ]   1.14.11.- [ KEGG ]   
PhosPhoSitePlusQ6B0I6
Domaine pattern : Prosite (Expaxy)JMJC (PS51184)    JMJN (PS51183)   
Domains : Interpro (EBI)JmjC_dom    JmjN   
Domain families : Pfam (Sanger)JmjC (PF02373)    JmjN (PF02375)   
Domain families : Pfam (NCBI)pfam02373    pfam02375   
Domain families : Smart (EMBL)JmjC (SM00558)  JmjN (SM00545)  
Conserved Domain (NCBI)KDM4D
DMDM Disease mutations55693
Blocks (Seattle)KDM4D
PDB (SRS)3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
PDB (PDBSum)3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
PDB (IMB)3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
PDB (RSDB)3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
Structural Biology KnowledgeBase3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
SCOP (Structural Classification of Proteins)3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
CATH (Classification of proteins structures)3DXT    3DXU    4D6Q    4D6R    4D6S    4HON    4HOO    5F5A    5F5C    5FP4    5FP7    5FP8    5FP9    5FPA    5FPB    5PH0    5PH1    5PH2    5PH3    5PH4    5PH5    5PH6    5PH7    5PH8    5PH9    5PHA    5PHB    5PHC    5PHD    5PHE    5PHF    5PHG    5PHH    5PHI    5PHJ    5PHK    5PHL    5PHM    5PHN    5PHO    5PHP    5PHQ    5PHR    5PHS    5PHT    5PHU    5PHV    5PHW    5PHX    5PHY    5PHZ    5PI0    5PI1    5PI2    5PI3    5PI4    5PI5    5PI6    5PI7    5PI8    5PI9    5PIA    5PIB    5PIC    5PID    5PIE    5PIF    5PIG    5PIH    5PII    5PIJ    5PIK    5PIL    5PIM    5PIN    5PIO    5PIP    5PIQ    5PIR    5PIS    5PIT    5PIU    5PIV    5PIW    5PIX    5PIY    5PIZ    5PJ0    5PJ1    5PJ2    5PJ3    5PJ4    5PJ5    5PJ6    5PJ7    5PJ8    5PJ9    5PJA    5PJB    5PJC    5PJD    5PJE    5PJF    5PJG    5PJH    5PJI    5PJJ    5PJK    5PJL    5PJM    5PJN    5PJO    5PJP    5PJQ    5PJR    5PJS    5PJT    5PJU    5PJV    5PJW    5PJX    5PJY    5PJZ    5PK0    5PK1    5PK2    5PK3    5PK4    5PK5    5PK6    5PK7    5PK8    5PK9    5PKA    5PKB    5PKC    5PKD    5PKE    5PKF    5PKG    5PKH    5PKI    5PKJ    5PKK    5PKL    5PKM    5PKN    5PKO    5PKP    5PKQ    5PKR    5PKS    5PKT    5PKU    5PKV    5PKW    5PKX    5PKY    5PKZ    5PL0    5PL1    5PL2    5PL3    5PL4    5PL5    5PL6    5PL7    5PL8    5PL9    5PLA    5PLB    5PLC    5PLD    5PLE    5PLF    5PLG    5PLH    5PLI    5PLJ    5PLK    5PLL    5PLM    5PLN    5PLO    5PLP    5PLQ    5PLR    5PLS    5PLT    5PLU    5PLV    5PLW    5PLX    5PLY    5PLZ    5PM0    5PM1    5PM2    5PM3    5PM4    5PM5    5PM6    5PM7    5PM8    5PM9    5PMA    5PMB    5PMC    5PMD    5PME    5PMF    5PMG    5PMH    5PMI    5PMJ    5PMK    5PML    5PMM    5PMN    5PMO    5PMP    5PMQ    5PMR    5PMS    5PMT    5PMU    5PMV    5PMW    5PMX    5PMY    5PMZ    5PN0    5PN1    5PN2    5PN3    5PN4    5PN5    5PN6    5PN7    5PN8    5PN9    5PNA    5PNB    5PNC    5PND    5PNE    5PNF    5PNG    5PNH    5PNI    5PNJ    5PNK    5PNL    5PNM    5PNN    5PNO    5PNP    5PNQ    5PNR    5PNS    5PNU    5PNV    5PNW   
SuperfamilyQ6B0I6
Human Protein Atlas [tissue]ENSG00000186280-KDM4D [tissue]
Peptide AtlasQ6B0I6
HPRD17169
IPIIPI00017991   
Protein Interaction databases
DIP (DOE-UCLA)Q6B0I6
IntAct (EBI)Q6B0I6
FunCoupENSG00000186280
BioGRIDKDM4D
STRING (EMBL)KDM4D
ZODIACKDM4D
Ontologies - Pathways
QuickGOQ6B0I6
Ontology : AmiGOnegative regulation of transcription by RNA polymerase II  double-strand break repair via homologous recombination  proximal promoter DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  regulation of protein phosphorylation  chromatin binding  damaged DNA binding  nucleus  nucleoplasm  pericentric heterochromatin  chromatin DNA binding  histone demethylase activity  histone demethylase activity  histone demethylase activity (H3-K9 specific)  histone demethylase activity (H3-K9 specific)  histone H3-K9 demethylation  methylated histone binding  histone methyltransferase complex  positive regulation of chromatin binding  site of double-strand break  metal ion binding  dioxygenase activity  oxidation-reduction process  cellular response to ionizing radiation  blood microparticle  negative regulation of histone H3-K9 trimethylation  positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining  
Ontology : EGO-EBInegative regulation of transcription by RNA polymerase II  double-strand break repair via homologous recombination  proximal promoter DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  regulation of protein phosphorylation  chromatin binding  damaged DNA binding  nucleus  nucleoplasm  pericentric heterochromatin  chromatin DNA binding  histone demethylase activity  histone demethylase activity  histone demethylase activity (H3-K9 specific)  histone demethylase activity (H3-K9 specific)  histone H3-K9 demethylation  methylated histone binding  histone methyltransferase complex  positive regulation of chromatin binding  site of double-strand break  metal ion binding  dioxygenase activity  oxidation-reduction process  cellular response to ionizing radiation  blood microparticle  negative regulation of histone H3-K9 trimethylation  positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining  
NDEx NetworkKDM4D
Atlas of Cancer Signalling NetworkKDM4D
Wikipedia pathwaysKDM4D
Orthology - Evolution
OrthoDB55693
GeneTree (enSembl)ENSG00000186280
Phylogenetic Trees/Animal Genes : TreeFamKDM4D
HOVERGENQ6B0I6
HOGENOMQ6B0I6
Homologs : HomoloGeneKDM4D
Homology/Alignments : Family Browser (UCSC)KDM4D
Gene fusions - Rearrangements
Fusion : QuiverKDM4D
Polymorphisms : SNP and Copy number variants
NCBI Variation ViewerKDM4D [hg38]
dbSNP Single Nucleotide Polymorphism (NCBI)KDM4D
dbVarKDM4D
ClinVarKDM4D
1000_GenomesKDM4D 
Exome Variant ServerKDM4D
ExAC (Exome Aggregation Consortium)ENSG00000186280
GNOMAD BrowserENSG00000186280
Varsome BrowserKDM4D
Genetic variants : HAPMAP55693
Genomic Variants (DGV)KDM4D [DGVbeta]
DECIPHERKDM4D [patients]   [syndromes]   [variants]   [genes]  
CONAN: Copy Number AnalysisKDM4D 
Mutations
ICGC Data PortalKDM4D 
TCGA Data PortalKDM4D 
Broad Tumor PortalKDM4D
OASIS PortalKDM4D [ Somatic mutations - Copy number]
Somatic Mutations in Cancer : COSMICKDM4D  [overview]  [genome browser]  [tissue]  [distribution]  
Mutations and Diseases : HGMDKDM4D
LOVD (Leiden Open Variation Database)Whole genome datasets
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD - Leiden Open Variation Database
LOVD (Leiden Open Variation Database)LOVD 3.0 shared installation
BioMutasearch KDM4D
DgiDB (Drug Gene Interaction Database)KDM4D
DoCM (Curated mutations)KDM4D (select the gene name)
CIViC (Clinical Interpretations of Variants in Cancer)KDM4D (select a term)
intoGenKDM4D
Cancer3DKDM4D(select the gene name)
Impact of mutations[PolyPhen2] [Provean] [Buck Institute : MutDB] [Mutation Assessor] [Mutanalyser]
Diseases
OMIM609766   
Orphanet
DisGeNETKDM4D
MedgenKDM4D
Genetic Testing Registry KDM4D
NextProtQ6B0I6 [Medical]
TSGene55693
GENETestsKDM4D
Target ValidationKDM4D
Huge Navigator KDM4D [HugePedia]
snp3D : Map Gene to Disease55693
BioCentury BCIQKDM4D
ClinGenKDM4D
Clinical trials, drugs, therapy
Chemical/Protein Interactions : CTD55693
Chemical/Pharm GKB GenePA164721552
Clinical trialKDM4D
Miscellaneous
canSAR (ICR)KDM4D (select the gene name)
Probes
Litterature
PubMed26 Pubmed reference(s) in Entrez
GeneRIFsGene References Into Functions (Entrez)
CoreMineKDM4D
EVEXKDM4D
GoPubMedKDM4D
iHOPKDM4D
Genes in titleautomatic search in PubMed
REVIEW articlesautomatic search in PubMed
Last year publicationsautomatic search in PubMed

Search in all EBI   NCBI

© Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology
indexed on : Tue Nov 6 11:14:49 CET 2018

Home   Genes   Leukemias   Solid Tumors   Cancer-Prone   Deep Insight   Case Reports   Journals  Portal   Teaching   

For comments and suggestions or contributions, please contact us

jlhuret@AtlasGeneticsOncology.org.