基因举例: 免疫球蛋白基因


Contributor(s)

Written 2024-04-19 郎兴萍~Sheng Xiao
苏州精准医疗科技有限公司~ Brigham and Women's Hospital


Abstract

简介

I 历史问题

II 答案

II.1 轻链(kappa或lambda)

II.1.1 kappa链:V-J重排

II.1.2 Lambda链:V-J重排

II.1.3 等位基因互斥和同种型

II.2 重链

II.2.1 V-D-J重排

II.2.2 同种型转换

II.3 膜型和分泌型免疫球蛋白

III 结论

III.1. 胚系多样性:多基因家族

III.2. DNA重排导致的多样性

III.3. 体细胞超突变导致的多样性


Content

简介

      免疫球蛋白(Ig)由2条相同的轻链(L)和2条相同的重链(H)(例如IgG型)组成;在三维水平上,一条Ig链由一个N端可变域,V区,和一个(L链)或多个(H链)C端恒定域C区组成。

       免疫球蛋白是由B淋巴细胞产生的。它可以在B淋巴细胞膜表面生成,也可以由浆细胞分泌产生。


图1 轻链可变区V-J和重链可变区V-D-J分别对应一个可变结构域。轻链恒定区CL对应一个恒定结构域。

重链恒定区对应4个恒定结构域包括CH1-CH4(IgM和IgE),或者3个恒定结构域(IgD,IgG和IgA),其中CH1和CH2结构域被铰链区分开。


I 历史问题

      发现免疫球蛋白的主要特征后,随之而来有了一些相关疑问:

A

  • 抗原具有多样性;为了能够对它们做出反应,免疫球蛋白必须具有相同的多样性(有1011至1012种不同的抗体!),对应于L和H链N端氨基酸多样性(即可变结构域)。
  • 是否因为编码免疫球蛋白的基因具有极端多样性?(与胚系理论的模型一致:1个基因= 1条Ig链;在这种情况下,必须牵涉许多基因;它们可能源于祖先基因的重复;但整个人类基因组不足以编码所有的免疫球蛋白!)。
  • 是否因为基因突变的积累?(与体细胞突变理论模型一致:在这种情况下,只牵涉到少数基因,但是随后必须发生许多体细胞突变才能产生免疫球蛋白的多样性;然而,这种模型和公认的遗传学原理相反)。
  • 是否因为免疫球蛋白基因具有特殊的机制?

B

  • 在其分化过程中,B细胞首先在B淋巴细胞表面产生膜型免疫球蛋白,然后再产生由浆细胞分泌的免疫球蛋白。膜型和分泌型免疫球蛋白重链的氨基酸序列仅在C末端不同:这两种情况是否涉及相同的基因?

C

  • B细胞首先在其表面表达IgM,然后在分化过程中可能表达另一类Ig(IgG,IgE或IgA)(这种机制称为同种型转换):这种转换如何发生?我们如何解释,无论产生何种免疫球蛋白同种型,都表达相同的特异性抗原可变域(相同的独特型)?

D

  • 即使B细胞的基因组中每个Ig基因有2条染色体(2个等位基因),它也可以合成一种重链和轻链。因此一定会发生等位基因互斥,并产生半合子表型。那么等位基因互斥是如何发生的?

E

  • 最后,如果可变区确实发生了突变,为什么恒定区中没有突变?
  • 在小鼠和人类中,分子生物学和基因克隆中使用了各种方法来回答这些问题。我们这里仅讨论人类免疫球蛋白。


II 答案

II.1 轻链(kappa或lambda)

II.1.1 Kappa链:V-J重排

  • IGK(kappa)基因位于2号染色体2p11。
  • 可变区包括多个IGKV基因,V(76个基因,其中31-35个功能基因);连接区包括5个IGKJ基因的;恒定区包括1个IGKC基因;V,J和C基因在基因组中是不连续的(Ig基因的“胚系”构型)。
  • 这些是多基因家族(另请参阅有关基因家族中,Globin基因的部分,“...祖先基因的复制相互继承,每个基因突变导致了一定程度的多样性。这些复制的基因是有功能的...”)。
  • 首先,DNA进行了重排:因此1个V和1个J基因可以连接;然后删除中间序列,
  • mRNA前体被复制(转录);包括内含子,
  • 然后进行剪接:从信使RNA前体中去除内含子,产生成熟的mRNA,
  • 随后是蛋白质合成(称为“翻译”)。
  • 注意不要将DNA重排与RNA剪接混淆。

注意:只有免疫球蛋白和T受体基因会进行DNA重排。


图2

  • V-J重排发生在重组信号(RS)处,该信号包括由间隔子分隔的七聚序列(7个核苷酸)和非异构序列(9个核苷酸)。

每个IGKV基因的下游(3'位置)有一段RS,包括CACAGTG七聚体,12 bp间隔子和一段ACAAAAACC九聚体。

每个IGKJ基因的上游(5'位置)有一段RS,从5'和3'依次是GGTTTTTGT九聚体,23 bp间隔子和CACTGTG七聚体。


图3


II.1.2 Lambda链:V-J重排

  • IGL(λ)基因位于22号染色体22q11;V-J重排机制与IGK基因机制相同:重排发生在IGLV基因的29-33功能基因与J基因之间;需要注意的是,有4-5个功能性IGLC基因,每个基因之前都有一个IGLJ基因。


II.1.3 等位基因互斥和亚型


  • 等位基因互斥原因,一方面是重排时间,另一方面是功能性免疫球蛋白的表面表达,其抑制了重排并因此抑制了第二条链的表达。因此,只有一条14号染色体和一条2号(或22号)染色体可以发挥功能(问题D的答案)。


II.2 重链

  • IGH(重链)基因位于14号染色体14q32。
  • 共有11个IGHC基因,其中9个是有功能的(IGHM,IGHD,IGHG1,IGHG2,IGHG3,IGHG4,IGHA1,IGHA2和IGHE),分别对应于9种重链亚型 µ, δ, ɣ1, ɣ2, ɣ3, ɣ4, α1, α2和ɛ。


II.2.1 V-D-J重排

  • DNA重排发生在IGHV基因 (38-46个功能可变的V基因), IGHD基因 (23个功能多样的D基因)和IGHJ基因(6个具有连接功能的J基因)之间:还有一些RSs序列,位于V基因的下游(3'位置) ,D基因的任意一侧和J基因的上游(5'位置)。在V-D-J重排过程中,首先是D基因和J基因发生重排,然后 V基因和再和D-J之间连接起来。

图4

  • 注意:D基因也有2或3个开放阅读框;每个都可以编码2或3个不同的肽序列。 V-D-J连接还有个特征是核苷酸的缺失(通过核酸外切酶)和核苷酸的随机添加(通过TdT,末端脱氧核苷酸转移酶);因此,V区基因在个体基因组中不编码蛋白,并大大增加了免疫球蛋白重链可变区的V-D-J连接多样性。


II.2.2 同种型转换

  • 在前B淋巴细胞中,由于恒定的IGHM基因(C)位于V-D-J重排附近,因此首先要合成一条μ链。该μ链与伪轻链相关,并且该组合构成前B受体。B淋巴细胞合成的第一个完整免疫球蛋白是IgM,其中μ链与轻κ或λ链结合。
  • 在其分化过程中,B淋巴细胞可以表达Ig的某些其他同种型或亚同种型。由于DNA重组(同种型转换),这涉及到一个IGHC基因被另一个替换,并切除了缺失环的整个中间部分。该切除发生在转换序列(与RSs相关的角色)上。
  • 然后,通用序列按照如下:mRNA前体合成,内含子的剪接,产生成熟的RNA,然后进行蛋白质合成。
  • 这解释了为什么1)B淋巴细胞首先可以合成IgM,然后在分化过程中合成IgG(IgG1,IgG2,IgG3或IgG4),IgA(IgA1或IgA2)或IgE,以及2)保留相同的VDJ重排,因此具有相同的抗原识别位点(独特型)(问题C的答案)。


图5


II.3 膜型和分泌型免疫球蛋白

  • 重链信使前RNA的可变剪接可以产生膜型重链(B淋巴细胞膜型Ig)或分泌型重链(浆细胞分泌型Ig),它们保留相同的V-D-J重排(独特型)和相同的恒定区域(同种型)(问题B的答案)。


  • 注意:在同一B细胞(成熟B细胞离开骨髓并通过循环到达淋巴结)中表达IgM和IgD的机制相同(前体mRNA的选择性剪接)。


III 结论

III.1 胚系多样性:多基因家族

  • “胚系”的多样性取决于每个基因座上的基因数量。这些是家族基因,如何在相似序列之间进行选择?根据功能序列。基因间重组可以通过基因的复制或缺失,使基因座长期进化。
  • 这些基因经历基因内转换和重组,从而导致个体之间的混合性和多样性(多态性)。
  • 在IGHD基因中,存在几个开放阅读框,进一步增加了在相似功能序列之间进行选择的可能性。


III.2 DNA重排导致的多样性

  • 组合多样性-理论上来讲可以合成一百万种免疫球蛋白。IGH基因可以合成大约6000条重链,IGK或IGL基因可以合成大约160条轻链,这相当于大约一百万种可能的组合(6 × 10 3 × 160)。


  • 除此之外,在重链IGH的重排过程中,获取N区域,并在V-D-J连接处对D基因使用一个或其他的阅读框,以及在IGK或IGL重排过程中,V-J连接的灵活性。这些机制有助于将多样性提高103到104倍(可能会合成109 Ig链)。


III.3 体细胞超突变导致的多样性

      最后,体细胞突变非常多(体细胞超突变),可对Ig的重排V-J和V-D-J基因产生非常有针对性的表征,但其发病机理尚不清楚。 AID(激活诱导的胞苷脱氨酶)可能与突变的发生和转换机制有关。在淋巴结中,B淋巴细胞分化过程中发生体细胞超突变,有助于多样性增加103倍,最终免疫球蛋白多样性有可能会达到1012种(答案A)。

      这些机制使得免疫球蛋白多样性有可能会达到1012种,它们能够对数百万种已知抗原作出反应(问题A的答案)。

      实际上,不同Ig的数量受给定物种中B细胞数量的限制。


Citation

郎兴萍~Sheng Xiao

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology 2024-04-19

基因举例: 免疫球蛋白基因

Online version: http://atlasgeneticsoncology.org/teaching/209217/